02 染色體與DNA

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1、第二章 染色體與DNAn 染色體n DNA的結(jié)構(gòu)n DNA的復(fù)制n DNA的修復(fù)n DNA的轉(zhuǎn)座一、染色體(Chromosome)內(nèi)容提要:細(xì)胞周期染色體與染色質(zhì)染色體的結(jié)構(gòu)和組成(原核生物、真核生物)核小體原核生物和真核生物基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)比較 (一)細(xì)胞周期(二)染色體與染色質(zhì)染色體(染色體(chromosome)是細(xì)胞在有絲分裂時(shí)遺傳物質(zhì))是細(xì)胞在有絲分裂時(shí)遺傳物質(zhì)存在的特定形式,是間期細(xì)胞染色質(zhì)結(jié)構(gòu)緊密包裝的結(jié)存在的特定形式,是間期細(xì)胞染色質(zhì)結(jié)構(gòu)緊密包裝的結(jié)果。果。真核生物的染色體在細(xì)胞生活周期的大部分時(shí)間里都是真核生物的染色體在細(xì)胞生活周期的大部分時(shí)間里都是以染色質(zhì)以染色質(zhì)(chrom

2、atin)的形式存在的。的形式存在的。染色質(zhì)是一種纖維狀結(jié)構(gòu),叫做染色質(zhì)絲,它是由最基染色質(zhì)是一種纖維狀結(jié)構(gòu),叫做染色質(zhì)絲,它是由最基本的單位本的單位核小體核小體(nucleosome)成串排列而成的。成串排列而成的。(三)染色體的結(jié)構(gòu)和組成原核生物(prokaryote)組蛋白:H1 H2A H2B H3 H4非組蛋白核小體DNA蛋白質(zhì)染色體真核生物染色體的組成組蛋白的一般特性:進(jìn)化上的保守性保守程度:H1 H2A、H2B H3、H41、組蛋白 上海生化所分子遺傳學(xué)1998年試題:在真核生物核內(nèi)。五種組蛋白(H1 H2A H2B H3 和H4)在進(jìn)化過程中,H4極為保守,H2A最不保守()無

3、組織特異性肽鏈氨基酸分布的不對稱性H5組蛋白的特殊性:富含賴氨酸(24%)組蛋白的可修飾性簡述真核生物染色體上組蛋白的種類,組蛋白修飾的種類及其生物學(xué)意義中國科學(xué)院2003年碩士研究生入學(xué)生物化學(xué)與分子生物學(xué)試題 在細(xì)胞周期特定時(shí)間可發(fā)生甲基化、乙?;?、磷酸化和ADP核糖基化等。H3、H4修飾作用較普遍,H2B有乙酰化作用、H1有磷酸化作用。所有這些修飾作用都有一個(gè)共同的特點(diǎn),即降低組蛋白所有這些修飾作用都有一個(gè)共同的特點(diǎn),即降低組蛋白所攜帶的正電荷。所攜帶的正電荷。這些組蛋白修飾的意義:一是改變?nèi)旧w的結(jié)構(gòu),直接影響轉(zhuǎn)錄活性;二是核小體表面發(fā)生改變,使其他調(diào)控蛋白易于和染色質(zhì)相互接觸,從而間

4、接影響轉(zhuǎn)錄活性。組蛋白的可修飾性1)DNA的變性和復(fù)性 變性(Denaturation)DNA雙鏈的氫鍵斷裂,最后完全變成單鏈的過程稱為變性。增色效應(yīng)(Hyperchromatic effect)在加熱變性過程中,260nm紫外線吸收值先緩慢上升,當(dāng)達(dá)到某一溫度時(shí)驟然上升,稱為增色效應(yīng)。2、DNA的結(jié)構(gòu)熔解溫度(Melting temperature,Tm)變性過程紫外線吸收值增加的中點(diǎn)稱為熔解溫度。生理?xiàng)l件下為85-95影響因素:G+C含量,pH值,離子強(qiáng)度,尿素,甲酰胺等復(fù)性(Renaturation)熱變性的DNA緩慢冷卻,單鏈恢復(fù)成雙鏈。減色效應(yīng)(Hypochromatic effec

5、t)隨著DNA的復(fù)性,260nm紫外線吸收值降低的現(xiàn)象。2)C值反常現(xiàn)象(C-value paradox)C值是一種生物的單倍體基因組DNA的總量。形態(tài)學(xué)的復(fù)雜程度與C值大小的不一致,稱為“C值反常現(xiàn)象”/C值矛盾/C值悖理。真核細(xì)胞基因組的最大特點(diǎn)是它含有大量的重復(fù)序列,而且功能DNA序列大多被不編碼蛋白質(zhì)的非功能DNA所隔開。C值矛盾P351簡述DNA的C值以及C值矛盾(C Value paradox).中科院上海生化所 98 年上海第二軍醫(yī)大:C值矛盾(四)核小體(nucleosome)(nucleosome)Nucleosome、chromosome、genome 中科院2002年碩士

6、學(xué)位研究生入學(xué)分子遺傳學(xué)試題 1、定義:用于包裝染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)單位,是由DNA鏈纏繞一個(gè)組蛋白核構(gòu)成的。2、核小體的結(jié)構(gòu)核心顆粒、連接區(qū)DNA中國科學(xué)院上海生化與細(xì)胞所2002年招收碩士研究生分子遺傳學(xué)入學(xué)考試:簡述真核細(xì)胞內(nèi)核小體與核小體核心顆粒的結(jié)構(gòu)。3、染色體的包裝超螺旋結(jié)構(gòu)6.8:140:11000:18000:1DNA double helixNucleosome(10 nm fiber)30 nm FiberLoops ILoops IIchromosome上海第二軍醫(yī)大碩士研究生入學(xué)考試試題:基因組的特點(diǎn)(真核、原核比較)(五)原核生物和真核生物基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)比較 基因組很小,大多

7、只有一條染色體 結(jié)構(gòu)簡煉 存在轉(zhuǎn)錄單元(trnascriptional operon)多順反子(polycistron)X174 D-E-J-F-G-H mRNA 蛋白J、F、G H D EE.coli 色氨酸操縱子 9個(gè)順反子 9個(gè)酶1、原核生物基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn) 有重疊基因(Sanger 發(fā)現(xiàn))基因內(nèi)基因 部分重疊基因 一個(gè)堿基重疊2、真核生物基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)l真核基因組結(jié)構(gòu)龐大 3109bp、染色質(zhì)、核膜l單順反子l基因不連續(xù)性 斷裂基因(interrupted gene)、內(nèi)含子(intron)、外顯子(exon)l非編碼區(qū)較多 多于編碼序列(9:1)l 含有大量重復(fù)序列l(wèi)具有端粒結(jié)構(gòu) 不重

8、復(fù)序列/單一序列:在基因組中有一個(gè)或幾個(gè)拷貝。占DNA總量的40%-80%。真核生物的大多數(shù)基因在單倍體中都是單拷貝的。如:蛋清蛋白、血紅蛋白等。功能:主要是編碼蛋白質(zhì)。中度重復(fù)序列:在基因組中的拷貝數(shù)為101104。占DNA總量的10%-40%。如:rRNA、tRNA 一般是不編碼蛋白質(zhì)的序列,在調(diào)控基因表達(dá)中起重要作用。根據(jù) DNA復(fù)性動(dòng)力學(xué)研究,DNA序列可以分成哪幾種類型?并加以舉例說明。(2001年上海生化所)高度重復(fù)序列:拷貝數(shù)達(dá)到幾百個(gè)到幾百萬個(gè)。占DNA總量的10%-60%。衛(wèi)星DNA:A T含量很高的簡單高度重復(fù)序列。只在高等生物中發(fā)現(xiàn)。第二章 染色體與DNAn 染色體n D

9、NA的結(jié)構(gòu)n DNA的復(fù)制n DNA的修復(fù)n DNA的轉(zhuǎn)座二、DNA的結(jié)構(gòu)1 1)概念概念 指4種脫氧核苷酸的連接及其排列順序,DNA序列是這一概念的簡稱。堿基序列1、DNA的一級結(jié)構(gòu)2)特征:雙鏈反向平行配對而成脫氧核糖和磷酸交替連接,構(gòu)成DNA骨架,堿基排在內(nèi)側(cè)內(nèi)側(cè)堿基通過氫鍵互補(bǔ)形成堿基對(A:T,C:G)。3)DNA結(jié)構(gòu)的表示法2 2、DNA DNA 的二級結(jié)構(gòu)的二級結(jié)構(gòu)1)定義:指兩條多核苷酸鏈反向平行盤繞所產(chǎn)生的雙螺旋結(jié)構(gòu)。繞DNA雙螺旋表面上出現(xiàn)的螺旋槽(溝),寬的溝稱為大溝,窄溝稱為小溝。大溝、小溝都是由于堿基對堆積和糖-磷酸骨架扭轉(zhuǎn)造成的。DNA雙螺旋模型是哪年由誰提出的?簡

10、述其基本內(nèi)容.為什么說該模型的提出是分子生物學(xué)發(fā)展史上的里程碑,具有劃時(shí)代的貢獻(xiàn)?浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院2003生物化學(xué)(碩士)2)分類:右手螺旋:A-DNA,B-DNA左手螺旋:Z-DNAABZABZ3、DNA的高級結(jié)構(gòu)1)定義:指DNA雙螺旋進(jìn)一步扭曲盤繞所形成的特定空間結(jié)構(gòu)。是一種比雙螺旋更高層次的空間構(gòu)象。2)主要形式:超螺旋結(jié)構(gòu)(正超螺旋和負(fù)超螺旋)線狀DNA形成的超螺旋環(huán)狀DNA形成的超螺旋拓?fù)洚悩?gòu)酶or溴化乙錠拓?fù)洚悩?gòu)酶or溴化乙錠DNA扭曲與雙螺旋相同(擰緊)DNA扭曲與雙螺旋相反(松開)負(fù)超螺旋松弛DNA正超螺旋第二章 染色體與DNAn 染色體n DNA的結(jié)構(gòu)n DNA的復(fù)制n DN

11、A的修復(fù)n DNA的轉(zhuǎn)座第三節(jié) DNA的復(fù)制DNARNA蛋白質(zhì)復(fù)制轉(zhuǎn)錄翻譯逆轉(zhuǎn)錄RNA復(fù)制內(nèi)容提要:DNA的半保留復(fù)制與DNA復(fù)制有關(guān)的物質(zhì) DNA的復(fù)制過程(大腸桿菌為例)DNA復(fù)制的其它方式真核生物中DNA的復(fù)制特點(diǎn)端粒DNA的復(fù)制1、定義:由親代DNA生成子代DNA時(shí),每個(gè)新形成的子代DNA中,一條鏈來自親代DNA,而另一條鏈則是新合成的,這種復(fù)制方式稱半保留復(fù)制。(一)DNA的半保留復(fù)制(semi-conservative replication)Semi-conservative Conservative Dispersive 中國科學(xué)院上海生化與細(xì)胞所2002年招收碩士研究生分子遺

12、傳學(xué)入學(xué)考試:請?jiān)O(shè)計(jì)一個(gè)實(shí)驗(yàn)來證明DNA復(fù)制是以半保留方式進(jìn)行的(8分)。2、實(shí)驗(yàn)證據(jù)(1958 Meselson 和Stahl):Matthew Messelson Franklin Stahl3、DNA半保留復(fù)制的生物學(xué)意義:DNA的半保留復(fù)制表明DNA在代謝上的穩(wěn)定性,保證親代的遺傳信息穩(wěn)定地傳遞給后代。(二)與DNA復(fù)制有關(guān)的物質(zhì)1、原料:四種脫氧核苷三磷酸(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)2、模板:以DNA的兩條鏈為模板鏈,合成子代DNA3、引物:DNA的合成需要一段RNA鏈作為引物4、引物合成酶(引發(fā)酶):此酶以DNA為模板合成一段RNA,這段RNA作為合成DNA的引物(P

13、rimer)。實(shí)質(zhì)是以DNA為模板的RNA聚合酶。5、DNA聚合酶:以DNA為模板的DNA合成酶以四種脫氧核苷酸三磷酸為底物反應(yīng)需要有模板的指導(dǎo)反應(yīng)需要有3-OH存在DNA鏈的合成方向?yàn)? 3 性質(zhì) 聚合酶聚合酶 聚合酶3 5 外切活性+5 3 外切活性+-5 3 聚合活性+中+很低+很高新生鏈合成-+主要是對主要是對DNADNA損傷的修損傷的修復(fù);以及在復(fù);以及在DNADNA復(fù)制時(shí)復(fù)制時(shí)切除切除RNARNA引物并填補(bǔ)其引物并填補(bǔ)其留下的空隙。留下的空隙。修復(fù)紫外修復(fù)紫外光引起的光引起的DNADNA損傷損傷DNA DNA 復(fù)制的主要復(fù)制的主要聚合酶,還具有聚合酶,還具有3 3-5-5 外切酶的

14、外切酶的校對功能,提高校對功能,提高DNADNA復(fù)制的保真性復(fù)制的保真性原核生物中的DNA聚合酶(大腸桿菌)定位 細(xì)胞核 細(xì)胞核 線粒體 細(xì)胞核 細(xì)胞核3-5外切 -+酶活性功能引物引物 合成合成修復(fù)修復(fù)作用作用線粒體線粒體DNADNA的復(fù)制的復(fù)制核核DNADNA的復(fù)制的復(fù)制?真核生物中的DNA聚合酶 6、DNA連接酶(1967年發(fā)現(xiàn)):若雙鏈DNA中一條鏈有切口,一端是3-OH,另一端是5-磷酸基,連接酶可催化這兩端形成磷酸二酯鍵,而使切口連接。但是它不能將兩條游離的DNA單鏈連接起來 DNADNA連接酶連接酶在在DNADNA復(fù)制、損傷修復(fù)、重組等過程復(fù)制、損傷修復(fù)、重組等過程中起重要作用中

15、起重要作用3535OHOHP P7、DNA 拓?fù)洚悩?gòu)酶(DNA Topisomerase):拓?fù)洚悩?gòu)酶:使DNA一條鏈發(fā)生斷裂和再連接,作用是松解負(fù)超螺旋。主要集中在活性轉(zhuǎn)錄區(qū),同轉(zhuǎn)錄有關(guān)。例:大腸桿菌中的蛋白 拓?fù)洚悩?gòu)酶:該酶能暫時(shí)性地切斷和重新連接雙鏈DNA,作用是將負(fù)超螺旋引入DNA分子。同復(fù)制有關(guān)。例:大腸桿菌中的DNA旋轉(zhuǎn)酶上海生化所1998年分子遺傳學(xué)試題:拓?fù)洚悩?gòu)酶8、DNA 解螺旋酶/解鏈酶(DNA helicase)通過水解ATP獲得能量來解開雙鏈DNA。E.coli中的rep蛋白就是解螺旋酶,還有解螺旋酶I、II、III。reprep蛋白沿蛋白沿3 3 5 5移動(dòng),而解螺旋

16、酶移動(dòng),而解螺旋酶I I、IIII、IIIIII沿沿5 5 3 3移動(dòng)。移動(dòng)。9、單鏈結(jié)合蛋白單鏈結(jié)合蛋白(SSBP-single-strand binding protein):穩(wěn)定已被解開的穩(wěn)定已被解開的DNA單鏈,阻止復(fù)單鏈,阻止復(fù)性和保護(hù)單鏈不被核酸酶降解。性和保護(hù)單鏈不被核酸酶降解。(三)DNA的復(fù)制過程(大腸桿菌為例)n 雙鏈的解開雙鏈的解開n RNARNA引物的合成引物的合成n DNADNA鏈的延伸鏈的延伸n 切除切除RNARNA引物,填補(bǔ)缺口,連接相鄰的引物,填補(bǔ)缺口,連接相鄰的DNADNA片段片段1 1、雙鏈的解開、雙鏈的解開 DNA的復(fù)制有特定的起始位點(diǎn),叫做復(fù)制原點(diǎn)。or

17、i(或o)、富含A、T的區(qū)段?;靖拍睿荷虾I?998年分子遺傳學(xué)試題:真核生物復(fù)制起始點(diǎn)的特征包括()A富含GC區(qū) B富含AT區(qū) C Z DNA D無明顯特征 從復(fù)制原點(diǎn)到終點(diǎn),組成一個(gè)復(fù)制單位,叫從復(fù)制原點(diǎn)到終點(diǎn),組成一個(gè)復(fù)制單位,叫復(fù)制子復(fù)制子復(fù)制時(shí),解鏈酶等先將DNA的一段雙鏈解開,形成復(fù)制點(diǎn),這個(gè)復(fù)制點(diǎn)的形狀象一個(gè)叉子,故稱為復(fù)制叉復(fù)制叉復(fù)制叉復(fù)制叉復(fù)制叉復(fù)制方向和速度:單單起點(diǎn)、起點(diǎn)、雙雙向等速向等速多多起點(diǎn)、起點(diǎn)、雙雙向等速向等速雙鏈解開、復(fù)制起始大約20個(gè)DnaA蛋白在ATP的作用下與oriC處的4個(gè)9bp保守序列相結(jié)合在HU蛋白和ATP的共同作用下,Dna復(fù)制起始復(fù)合物使

18、3個(gè)13bp直接重復(fù)序列變性,形成開鏈解鏈酶六體分別與單鏈DNA相結(jié)合(需DnaC幫助),進(jìn)一步解開DNA雙鏈2 2、RNARNA引物的合成引物的合成DnaB蛋白活化引物合成酶,引發(fā)RNA引物的合成。引物長度約為幾個(gè)至10個(gè)核苷酸,基因組DNA復(fù)制時(shí),先導(dǎo)鏈的引物是DNA,后隨鏈的引物是RNA(-)2002年上海生化與細(xì)胞所DNA的半不連續(xù)復(fù)制(semi-discontinuous replication)DNA復(fù)制時(shí)其中一條子鏈的合成是連續(xù)的,而另一條子鏈的合成是不連續(xù)的,故稱半不連續(xù)復(fù)制。在DNA復(fù)制時(shí),合成方向與復(fù)制叉移動(dòng)的方向一致并連續(xù)合成的鏈為前導(dǎo)鏈;合成方向與復(fù)制叉移動(dòng)的方向相反,

19、形成許多不連續(xù)的片段,最后再連成一條完整的DNA鏈為滯后鏈。3 3、DNADNA鏈的延伸鏈的延伸 在DNA復(fù)制過程中,前導(dǎo)鏈能連續(xù)合成,而滯后鏈只能是斷續(xù)的合成53 的多個(gè)短片段,這些不連續(xù)的小片段稱為岡崎片段。華中科技大學(xué)2004年生物化學(xué)與分子生物學(xué)碩士研究生入學(xué)試題名詞解釋:岡崎片段武漢大學(xué)2003年碩士研究生入學(xué)分子生物學(xué)試題:Replicon、semi-conservative replication 華中科技大學(xué)2004年生物化學(xué)與分子生物學(xué)碩士研究生入學(xué)試題 原核DNA合成酶中()的主要功能是合成前導(dǎo)鏈和岡崎片段A、DNA聚合酶 B、DNA聚合酶 C、DNA聚合酶 D、引物酶 4

20、 4、切除、切除RNARNA引物,填補(bǔ)缺口,連接相鄰的引物,填補(bǔ)缺口,連接相鄰的DNADNA片段片段 (復(fù)制終止)(復(fù)制終止)在DNA聚合酶催化下切除RNA引物;留下的空隙由DNA聚合酶催化合成一段DNA填補(bǔ)上;在DNA連接酶作用下,連接相鄰的DNA鏈(四)DNA復(fù)制的方式雙鏈環(huán)狀、型復(fù)制、雙向等速(1)模板鏈和新合成的鏈分開;(2)不需RNA引物,在正鏈3OH上延伸(3)只有一個(gè)復(fù)制叉;滾環(huán)型:單向復(fù)制的特殊方式如:174的雙鏈環(huán)狀DNA復(fù)制型(RF)D環(huán)復(fù)制單向復(fù)制的特殊方式如:動(dòng)物線粒體DNA(五)真核生物中DNA的復(fù)制特點(diǎn)1、真核生物每條染色體上有多個(gè)復(fù)制起點(diǎn),多復(fù)制子2、真核生物染色

21、體在全部復(fù)制完之前,各個(gè)起始點(diǎn)不再重新開始DNA復(fù)制;而在快速生長的原核生物中,復(fù)制起點(diǎn)可以連續(xù)開始新的復(fù)制(多復(fù)制叉)。真核生物快速生長時(shí),往往采用更多的復(fù)制起點(diǎn)。3、真核生物有多種DNA聚合酶。(六)(六)端粒端粒DNADNA的復(fù)制的復(fù)制.端粒(telomere)n真核生物染色體DNA是線性的 每復(fù)制一次,子鏈的5有缺失。n3端有特殊的序列,線性DNA末端的復(fù)制必須的-端粒n端粒特征:3端是由數(shù)百個(gè)串聯(lián)重復(fù)G豐富的6個(gè)核苷酸組成(AGGGTT)nn人:5-AGGGTTAGGGTT-3n端粒能穩(wěn)定染色體線形DNA復(fù)制末端問題2.端粒酶(telomerase)-防止端??s短的酶n組成 蛋白質(zhì)(

22、DNA聚合酶)+RNA(合成端粒DNA的模板)n唯一攜帶RNA模板的逆轉(zhuǎn)錄酶n人端粒酶:模板(RNA-端粒酶):3-CAAUCCCAAUC-5合成(DNA):5-AGGGTT-3n端粒酶和衰老、腫瘤有關(guān)DNA末端末端1.RNA和和DNA單鏈單鏈互補(bǔ)序列識別結(jié)合互補(bǔ)序列識別結(jié)合2.以以RNA為模板為模板 的逆轉(zhuǎn)錄過程的逆轉(zhuǎn)錄過程3.再發(fā)動(dòng)新一輪的合成延長再發(fā)動(dòng)新一輪的合成延長,合成較長的重復(fù)序列合成較長的重復(fù)序列3.端粒酶的作用機(jī)制4.以延長的以延長的DNA單鏈為模板單鏈為模板,3-OH為引物合成富含為引物合成富含C的的互補(bǔ)鏈互補(bǔ)鏈5.哺乳動(dòng)物中端粒末端形成大的環(huán)狀結(jié)構(gòu)哺乳動(dòng)物中端粒末端形成大的

23、環(huán)狀結(jié)構(gòu),環(huán)狀環(huán)狀DNA+蛋白質(zhì)蛋白質(zhì) 保護(hù)染色體保護(hù)染色體3端的穩(wěn)定端的穩(wěn)定圖圖12-17 12-17 端粒的環(huán)狀結(jié)構(gòu)端粒的環(huán)狀結(jié)構(gòu)第二章 染色體與DNAn 染色體n DNA的結(jié)構(gòu)n DNA的復(fù)制n DNA的修復(fù)n DNA的轉(zhuǎn)座第四節(jié)第四節(jié) DNADNA的損傷與修復(fù)的損傷與修復(fù)DNA修復(fù)的基礎(chǔ):一條鏈有損傷 修復(fù)酶切除 以未損傷的鏈為模板 合成原來相同的序列一一.造成損傷的原因造成損傷的原因n自發(fā)因素自發(fā)因素n物理因素物理因素n化學(xué)因素化學(xué)因素n隨機(jī)熱碰撞隨機(jī)熱碰撞n紫外線損傷(共軛雙鍵)紫外線損傷(共軛雙鍵)n電離輻射損傷(電離輻射損傷(X X線線/線)線)n亞硝酸鹽亞硝酸鹽 C UC U

24、n5-5-溴尿嘧啶溴尿嘧啶 5-BU A 5-BU A n氮芥類氮芥類 烷化劑烷化劑n羥胺羥胺 C-A C-A GG羥胺羥胺二二.DNA.DNA損傷類型損傷類型n點(diǎn)突變點(diǎn)突變n類型類型n結(jié)果結(jié)果n轉(zhuǎn)換-同型堿基n顛換-異型堿基n啟動(dòng)子/剪接信號 影響整個(gè)基因功能n編碼序列 蛋白質(zhì)功能改變n中性變化 AA變化,功能不變n靜止突變 堿基變,AA不變n缺失n插入n倒位n一個(gè)堿基/一段核苷酸/整個(gè)基因n一段原來沒有的堿基/核苷酸序列nDNA鏈內(nèi)部重組,一段方向顛倒三.修復(fù)機(jī)制DNA修復(fù)系統(tǒng)錯(cuò)配修復(fù)堿基切除修復(fù)核甘酸切除修復(fù)DNA直接修復(fù)功能恢復(fù)錯(cuò)配切除突變的堿基修復(fù)被破壞的DNA修復(fù)嘧啶二體或甲基化D

25、NA 扼要說明細(xì)胞中DNA修復(fù)系統(tǒng)有哪幾種(8分)中國科學(xué)院2002年碩士學(xué)位研究生入學(xué)分子遺傳學(xué)試題1、錯(cuò)配修復(fù)Dam甲基化酶使母鏈位于5GATC序列中腺甘酸甲基化甲基化緊隨在DNA復(fù)制之后進(jìn)行根據(jù)復(fù)制叉上DNA甲基化程度,切除尚未甲基化的子鏈上的錯(cuò)配堿基 根據(jù)母鏈甲基化原則找出錯(cuò)配堿基的示意圖發(fā)現(xiàn)錯(cuò)配堿基在水解ATP的作用下,MutS,MutL與堿基錯(cuò)配點(diǎn)的DNA雙鏈結(jié)合MutS-MutL在DNA雙鏈上移動(dòng),發(fā)現(xiàn)甲基化DNA后由MutH切開非甲基化的子鏈 甲基化指導(dǎo)的錯(cuò)配修復(fù)示意圖錯(cuò)配堿基位于切口3下游端,錯(cuò)配堿基位于切口5上游端,2、堿基切除修復(fù)一些堿基在自發(fā)或誘變下會(huì)發(fā)生脫酰胺,然后改

26、變配對性質(zhì),造成氨基轉(zhuǎn)換突變n腺嘌呤變?yōu)榇吸S嘌呤與胞嘧啶配對n鳥嘌呤變?yōu)辄S嘌呤與胞嘧啶配對n胞嘧啶變?yōu)槟蜞奏づc腺嘌呤配對胞嘧啶去氨基生成尿嘧啶如果復(fù)制發(fā)生就會(huì)產(chǎn)生一個(gè)突變糖苷水解酶識別改變了的堿基,把堿基從N-糖苷鍵處切下來,在DNA鏈上形成去嘌呤或去嘧啶位點(diǎn),統(tǒng)稱為AP位點(diǎn)。由AP磷酸內(nèi)切酶將受損核甘酸的糖苷-磷酸鍵切開。DNA連接酶連接利用DNA聚合酶I切除損傷部位,補(bǔ)上核苷酸3、核苷酸切除修復(fù)1)通過特異的核酸內(nèi)切酶識別損傷部位2)由酶的復(fù)合物在損傷的兩邊切除幾個(gè)核苷酸3)DNA 聚合酶以母鏈為模板復(fù)制合成新子鏈4)DNA連接酶將切口補(bǔ)平識別損傷部位損傷的兩邊切除幾個(gè)核苷酸DNA 聚合酶

27、以母鏈為模板復(fù)制合成新子鏈DNA連接酶將切口補(bǔ)平4、DNA的直接修復(fù)在DNA光解酶的作用下將環(huán)丁烷胸腺嘧啶二體和6-4光化物還原成為單體甲基轉(zhuǎn)移酶使O6-甲基鳥嘌呤脫甲基生成鳥嘌呤,防止G-T配對 上海生化所1998年分子遺傳學(xué)試題:DNA修復(fù)系統(tǒng)的作用是保證DNA序列不發(fā)生任何變化()第二章 染色體與DNAn 染色體n DNA的結(jié)構(gòu)n DNA的復(fù)制n DNA的修復(fù)n DNA的轉(zhuǎn)座第五節(jié) DNA轉(zhuǎn)座n 轉(zhuǎn)座因子轉(zhuǎn)座因子是一類可以進(jìn)入基因組內(nèi)不同位置的基是一類可以進(jìn)入基因組內(nèi)不同位置的基因載體??茖W(xué)家利用它們插入基因?qū)е峦蛔円粤私庖蜉d體??茖W(xué)家利用它們插入基因?qū)е峦蛔円粤私饣蚬δ?,也利用它們?/p>

28、育轉(zhuǎn)基因生物基因功能,也利用它們培育轉(zhuǎn)基因生物。n 麥克林托克麥克林托克(B.McClintock)因首先在玉米中發(fā)因首先在玉米中發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)座因子而獲得了現(xiàn)轉(zhuǎn)座因子而獲得了1983年諾貝爾醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。年諾貝爾醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。n 魯賓魯賓(G.Rubin)和斯普萊德林和斯普萊德林(A.Spradling)因因在在1982年發(fā)現(xiàn)年發(fā)現(xiàn)P轉(zhuǎn)座因子在果蠅中高效作用而當(dāng)選轉(zhuǎn)座因子在果蠅中高效作用而當(dāng)選美國科學(xué)院院士。美國科學(xué)院院士。n 復(fù)旦大學(xué)發(fā)育生物學(xué)研究所復(fù)旦大學(xué)發(fā)育生物學(xué)研究所吳曉暉吳曉暉將一種源將一種源于飛蛾的于飛蛾的PB轉(zhuǎn)座因子用于小鼠和人類細(xì)胞的轉(zhuǎn)座因子用于小鼠和人類細(xì)胞的基因功能研究,在世界上首次創(chuàng)立了一

29、個(gè)高效基因功能研究,在世界上首次創(chuàng)立了一個(gè)高效實(shí)用的實(shí)用的哺乳動(dòng)物轉(zhuǎn)座因子系統(tǒng)哺乳動(dòng)物轉(zhuǎn)座因子系統(tǒng),為大規(guī)模研究,為大規(guī)模研究哺乳動(dòng)物基因功能提供了新方法。該成果已由哺乳動(dòng)物基因功能提供了新方法。該成果已由國際頂級生命科學(xué)雜志國際頂級生命科學(xué)雜志細(xì)胞細(xì)胞作為封面故事作為封面故事發(fā)表發(fā)表 。一 概念n 轉(zhuǎn)座子(轉(zhuǎn)座子(transposon Tn)是存在于染色)是存在于染色體體DNA上可自主復(fù)制和移位的基本單位。上可自主復(fù)制和移位的基本單位。nDNA轉(zhuǎn)座是由可移位因子介導(dǎo)的遺傳物質(zhì)重排轉(zhuǎn)座是由可移位因子介導(dǎo)的遺傳物質(zhì)重排現(xiàn)象。現(xiàn)象。n 可移位因子的一個(gè)拷貝常常留在原來的位可移位因子的一個(gè)拷貝常常留

30、在原來的位置上,在新位點(diǎn)上出現(xiàn)的僅僅是它的拷貝,轉(zhuǎn)置上,在新位點(diǎn)上出現(xiàn)的僅僅是它的拷貝,轉(zhuǎn)座與同源重組不同,依賴于座與同源重組不同,依賴于DNA復(fù)制。復(fù)制。芭芭拉麥克林托克 n她在玉米中對可移動(dòng)基因轉(zhuǎn)座基因(俗稱“跳躍基因”)的研究。n玉米籽粒(或葉片)顏色的有無是受一些位于9號染色體上的基因控制的,例如控制色素形成的基因C?;蛟谌旧w上能移動(dòng)位置,也就是說能“轉(zhuǎn)座”,能“跳動(dòng)”,在當(dāng)時(shí)遺傳學(xué)家們那里簡直是聞所未聞。麥克林托克1950年發(fā)表的玉米易突變位點(diǎn)的由來與行為和1951年發(fā)表的染色體結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)兩篇論文,了解了別人她在做些什么工作之后,簡直不敢相信,都認(rèn)為這個(gè)女人也許是發(fā)瘋了。不久

31、她又發(fā)現(xiàn)了被稱為Spm的另一轉(zhuǎn)座突變調(diào)節(jié)體系。1963年泰勒發(fā)現(xiàn)噬菌體Mu能隨機(jī)地插入細(xì)菌染色體基因組內(nèi);1966年,貝克威斯等在大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)了可以整合在染色體上、也可游離于染色體外的F因子(性因子);60年代末,科學(xué)家們在大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)存在所謂的“插入序列”(IS);后又在沙門氏菌中發(fā)現(xiàn)了基因的流動(dòng)性(轉(zhuǎn)座子)和抗藥性基因等。1976年,在冷泉港召開的“DNA插入因子、質(zhì)粒和游離基因”專題討論會(huì)上,明確地承認(rèn)可用麥克林托克的術(shù)語“轉(zhuǎn)座因子”來說明所有能夠插入基因組的DNA片段。二 轉(zhuǎn)座子的類型和結(jié)構(gòu)特征原核生物轉(zhuǎn)座子的類型:1、插入序列(insertional sequence,IS)2、

32、復(fù)合轉(zhuǎn)座子(composite transposon)3、TnA家族1、插入序列(IS)IS是最簡單的轉(zhuǎn)座子,不含有任何宿主基因,它們是細(xì)菌染色體或質(zhì)粒DNA的正常組成部分。:IS1 復(fù)合轉(zhuǎn)座子是一類帶有某些抗藥性基因(或其他宿主基因)的轉(zhuǎn)座子,其兩翼往往是兩個(gè)相同或高度同源的IS序列 2、復(fù)合轉(zhuǎn)座子(composite transposon)三 轉(zhuǎn)座作用的機(jī)制復(fù)制性轉(zhuǎn)座子非復(fù)制性轉(zhuǎn)座子 上海生化所1998年分子遺傳學(xué)試題:轉(zhuǎn)座過程通常是指DNA中的一段特殊序列(轉(zhuǎn)座元)在轉(zhuǎn)座酶以及其它蛋白因子的作用下,從DNA分子中的一個(gè)位置被搬移到另一位置或另一DNA分子中()華中科技大學(xué)2004年生物化

33、學(xué)與分子生物學(xué)碩士研究生入學(xué)試題利用自己的位點(diǎn)專一重組酶把自己從寄主基因組中的一個(gè)地方移到另一個(gè)地方的遺傳元件叫()A、啟動(dòng)子 B、轉(zhuǎn)座子 C、T-DNA D、順反子中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所1996年碩士研究生分子遺傳學(xué)入學(xué)試題轉(zhuǎn)座子(transposon)反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子(retrotransposon)反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子(retrotransposon):指通過RNA為中介,反轉(zhuǎn)錄成DNA后進(jìn)行轉(zhuǎn)座的可動(dòng)元件。反轉(zhuǎn)錄病毒整合入宿主DNA中的分子機(jī)制,其本質(zhì)是轉(zhuǎn)座IS-兩端有 IR,只編碼轉(zhuǎn)座酶類轉(zhuǎn)座因子-結(jié)構(gòu)同 IS,但不能獨(dú)立存在,僅作為復(fù)合轉(zhuǎn)座子的兩端組件復(fù)合轉(zhuǎn)座子-兩端由 IS 或類

34、IS 構(gòu)成,可編碼抗抗菌素物質(zhì)原核TnA 轉(zhuǎn)座子家族-兩端為 IR,可編碼轉(zhuǎn)座酶、解離酶和抗性物質(zhì)AC-Ds-植物(玉米)中的激活-解離因子轉(zhuǎn)座子P 因子-果蠅中父本因子,在 MP中導(dǎo)致雜種不育反轉(zhuǎn)錄病毒、RNA DNA整合宿主靶 DNATyCopia病毒超家族LINSL1(1)有長末端重復(fù)序列(2)編碼反轉(zhuǎn)錄酶或整合酶(3)可含內(nèi)含子SINSB1/Alu(1)無重復(fù)序列(2)不編碼轉(zhuǎn)座子產(chǎn)物(3)無內(nèi)含子轉(zhuǎn)座因子真核反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子非病毒超家族假基因復(fù)習(xí)題1、證明DNA是遺傳物質(zhì)的兩個(gè)關(guān)鍵性實(shí)驗(yàn)是:肺炎鏈球菌在老鼠體內(nèi)的毒性和T2噬菌體感染大腸桿菌。這兩個(gè)實(shí)驗(yàn)中主要的論點(diǎn)證據(jù)是:()(a)從被感

35、染的生物體內(nèi)重新分離得到DNA,作為疾病的致病劑(b)DNA突變導(dǎo)致毒性喪失(c)生物體吸收的外源DNA(而并非蛋白質(zhì))改變了其遺傳潛能(d)DNA是不能在生物體間轉(zhuǎn)移的,因此它一定是一種非常保守的分子2、1953年Watson和Crick提出:()(a)多核苷酸DNA鏈通過氫鍵連接成一個(gè)雙螺旋(b)DNA的復(fù)制是半保留的,常常形成親本子代雙螺旋雜合鏈(c)三個(gè)連續(xù)的核苷酸代表一個(gè)遺傳密碼(d)遺傳物質(zhì)通常是DNA 而非RNA 3、下列哪一種蛋白不是組蛋白的成分()(a)H1 (b)H2A、H2B (c)H3、H4 (d)H5 4、DNA的變性:()(a)包括雙螺旋的解旋(b)可以由低溫產(chǎn)生(

36、c)是可逆的(d)是磷酸二酯鍵的斷裂(e)包括氫鍵的斷裂 5、DNA的二級結(jié)構(gòu)指:();(a)是指4種核苷酸的連接及其排列順序,表示了該DNA分子的化學(xué)構(gòu)成;(b)是指DNA雙螺旋進(jìn)一步扭曲盤繞所形成的特定空間結(jié)構(gòu);(c)是指兩條多核苷酸鏈反向平行盤繞所生成的雙螺旋結(jié)構(gòu)。6、在原核生物復(fù)制子中以下哪種酶除去RNA引發(fā)體并加入脫氧核糖核甘酸:(A)DNA聚合酶 (B)DNA聚合酶 (C)DNA聚合酶(D)外切核酸酶MFl 7、DNA復(fù)制時(shí)不需要以下哪種酶?()。(A)DNA指導(dǎo)的DNA聚合酶 (B)RNA指導(dǎo)的DNA聚合酶(C)拓?fù)洚悩?gòu)酶 (D)連接酶 8、DNA復(fù)制的特點(diǎn)()。A.半不連續(xù)復(fù)制 B.半保留復(fù)制C.都是等點(diǎn)開始、兩條鏈均連續(xù)復(fù)制 D.有DNA指導(dǎo)的DNA聚合酶參加 9、DNA復(fù)制時(shí)在前導(dǎo)鏈上DNA沿5-3方向合成,在滯后鏈上則沿3-5方向合成。()10、DNA的復(fù)制需要DNA聚合酶和RNA聚合酶()11、核小體是由H2A、H2B、H3、H4各兩個(gè)分子生成的()和由大約200bp DNA組成的。

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