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1、DNA片段的PCR擴(kuò)增
1.為什么DNA復(fù)制需要引物?
DNA的兩條鏈?zhǔn)欠聪蚱叫械?,為了明確地表示DNA的方向,通常將DNA的羥基末端稱為3′端,而磷酸基團(tuán)的末端稱為5′端。DNA聚合酶不能從頭開始合成DNA,而只能從3′端延伸DNA鏈,因此,DNA復(fù)制需要引物。當(dāng)引物與DNA母鏈通過堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合后,DNA聚合酶就能從引物的3′端開始延伸DNA鏈,DNA的合成方向總是從子鏈的5′端向3′端延伸。
DNA復(fù)制方向的示意圖
2.細(xì)胞內(nèi)參與DNA復(fù)制的各種組成成分和作用是怎樣的?
參與的組分
在DNA復(fù)制中的作用
解旋酶
打開DNA雙鏈
DNA母鏈
提供DNA復(fù)制的模
2、板
4種脫氧核苷酸
合成子鏈的原料
DNA聚合酶
催化合成DNA子鏈
引物
使DNA聚合酶能夠從引物的3′端開始連接脫氧核苷酸
3.細(xì)胞內(nèi)的DNA復(fù)制與體外DNA擴(kuò)增(PCR技術(shù))相同嗎??jī)烧哂钟惺裁搓P(guān)聯(lián)呢?
細(xì)胞內(nèi)的DNA復(fù)制與體外DNA擴(kuò)增(PCR技術(shù))是不同的,兩者具體比較見下表:
細(xì)胞內(nèi)DNA復(fù)制
PCR
不
同
點(diǎn)
解旋
有解旋酶的參與,邊解旋邊復(fù)制
80~100 ℃高度解旋,雙鏈完全分開
酶
DNA解旋酶、DNA聚合酶、DNA連接酶
TaqDNA聚合酶
引物
RNA
DNA或RNA
能量
ATP
不加
溫度
體內(nèi)溫和條件
3、
高溫
相同點(diǎn)
① 提供DNA復(fù)制的模板;
②四種脫氧核苷酸作原料;
③子鏈延伸的方向都是從5′端到3′端
PCR反應(yīng)是通過控制溫度使DNA復(fù)制在體外反復(fù)進(jìn)行。PCR反應(yīng)的實(shí)質(zhì)就是DNA復(fù)制,所以有關(guān)PCR反應(yīng)的題目與DNA復(fù)制的原理相同,計(jì)算方法也大體相同。例如:PCR反應(yīng)中的目的片段一般以2n的方式積累,其中n為反應(yīng)循環(huán)次數(shù)。一個(gè)DNA片段在30次循環(huán)后反應(yīng)物中大約有10億(230)個(gè)這樣的片段。
4.當(dāng)PCR反應(yīng)體系的溫度經(jīng)快速冷卻到50℃左右時(shí),為什么一般不考慮解開的2個(gè)DNA模板鏈又重新結(jié)合了,這是為什么?
原因是:(1)模板DNA比引物長(zhǎng)得多、復(fù)雜得多、不易重新
4、結(jié)合;
(2)引物和模板之間的碰撞機(jī)會(huì)遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于模板互補(bǔ)鏈之間的碰撞;
(3)加入的引物的量足夠大而模板鏈數(shù)量少,模板鏈濃度低,不易結(jié)合。
5.為什么PCR能有廣泛用途?除用于DNA擴(kuò)增外,還有哪些用途?
在生物基因組中存在著許多差異,如物種之間的差異、基因表達(dá)上的時(shí)間差異、基因表達(dá)的地域或組織差異、變異后的差異、生理和病理變化引起的差異、遺傳的差異、雜交的差異等。但這些差異只有在DNA擴(kuò)增后才能被觀察出來。因此,PCR是這種差異的一種觀察方法,因而在法醫(yī)學(xué)上、在遺傳病和其他疾病的診斷、考古中人種的確定、食品質(zhì)量的確定上和基因轉(zhuǎn)移上都可使用。
6.PCR的反應(yīng)過程具體是怎樣的?
5、
PCR一般要經(jīng)歷三十多次循環(huán),每次循環(huán)可以分為變性(當(dāng)溫度上升到90 ℃以上時(shí),雙鏈DNA解聚為單鏈)、復(fù)性(溫度下降到50 ℃左右,兩種引物通過堿基互補(bǔ)配對(duì)與兩條單鏈DNA結(jié)合)和延伸(溫度上升到72 ℃左右,溶液中的四種脫氧核苷酸在DNA聚合酶的作用下,根據(jù)堿基互補(bǔ)配對(duì)原則合成新的DNA鏈)三步。從第二輪循環(huán)開始,上一次循環(huán)的產(chǎn)物也作為模板參與反應(yīng),并且由引物Ⅰ延伸而成的DNA單鏈會(huì)與引物Ⅱ結(jié)合,進(jìn)行DNA的延伸,這樣,DNA聚合酶只能特異的復(fù)制處于兩個(gè)引物之間的DNA序列,使這段固定長(zhǎng)度的序列成指數(shù)擴(kuò)增。
第一輪的產(chǎn)物作為第二輪的模板,經(jīng)過變性、復(fù)性、延伸三步
↓
第二
6、輪的產(chǎn)物作為第三輪的模板,經(jīng)過變性、復(fù)性、延伸三步
↓
題例領(lǐng)悟TILILINGWU
【例題1】 一個(gè)由15N標(biāo)記的DNA分子,放在沒有標(biāo)記的環(huán)境中培養(yǎng),利用PCR循環(huán)5次后標(biāo)記的DNA分子占總數(shù)的( )
A.1/10 B.1/5
C.1/16 D.1/25
解析:一個(gè)DNA分子利用PCR技術(shù)循環(huán)5次后產(chǎn)生的DNA分子數(shù)目為2n。而DNA的復(fù)制是半保留復(fù)制,其特點(diǎn)是新形成的DNA雙鏈,一條是來自親代DNA分子的母鏈,另一條是新形成的子鏈。這樣最初由15N標(biāo)記的DNA分子復(fù)制后,其標(biāo)記的兩條鏈就分別進(jìn)入兩個(gè)子代DNA分子中,這樣兩個(gè)子代DNA分子被標(biāo)記了。以后均是
7、在沒有標(biāo)記的環(huán)境中培養(yǎng),不論經(jīng)過多少次復(fù)制,最初標(biāo)記的兩條鏈?zhǔn)冀K存在于兩個(gè)DNA分子中,這樣經(jīng)過n次循環(huán)后,標(biāo)記的DNA分子中的2/2n,即1/2n-1。
答案:C
PCR技術(shù)的實(shí)質(zhì)就是DNA分子的復(fù)制。
【例題2】 DNA的復(fù)制需要引物,其主要原因是…( )
A.可加快DNA的復(fù)制速度
B.引物可與DNA母鏈通過堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合
C.引物的5′端有助于DNA聚合酶的延伸DNA鏈
D.DNA聚合酶只能從3′端延伸DNA鏈
解析:DNA的兩條鏈?zhǔn)欠聪蚱叫械?,為了明確地表示DNA的方向,通常將DNA的羥基(—OH)末端稱為3′端,而磷酸基團(tuán)的末端稱為5′端。DNA聚合酶不
8、能從5′端開始合成DNA,而只能從3′端延伸DNA鏈。因此,DNA復(fù)制需要引物。當(dāng)引物與DNA母鏈通過堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合后,DNA聚合酶就能從引物的3′端開始延伸DNA鏈,DNA的合成方向總是從子鏈的5′端向3′端延伸。
答案:D
DNA復(fù)制是有方向的,只能由3′端延伸至5′端,而不能倒過來。
隨堂訓(xùn)練SUITANGXUNLIAN
11個(gè)PCR循環(huán)后,一個(gè)由15N標(biāo)記的DNA分子,放在沒有標(biāo)記的環(huán)境中培養(yǎng),可產(chǎn)生幾個(gè)含15N標(biāo)記的DNA分子( )
A.1個(gè) B.23=8個(gè)
C.2個(gè) D.4個(gè)
答案:C 解析:PCR的1次循環(huán),相當(dāng)于1個(gè)DNA分子復(fù)制了1次。因?yàn)镈NA的復(fù)制為半保留復(fù)制,所以形成了2個(gè)帶標(biāo)記的DNA分子。
2DNA復(fù)制需要引物,在引物的輔助下,DNA的復(fù)制(延伸)方向是怎樣的( )
A.由3′端延伸至5′端
B.由5′端延伸至3′端
C.由3′端和5′端都可以延伸
D.由DNA分子的中間氫鍵處開始延伸
答案:B 解析:由于DNA聚合酶只能由引物的3′端延伸DNA鏈,而DNA的兩條鏈?zhǔn)欠聪蚱叫械?,所以引物?′端對(duì)應(yīng)DNA子鏈的5′端,所以從子鏈的5′端向3′端延伸。
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