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1、DNA片段的PCR擴增
1.為什么DNA復制需要引物?
DNA的兩條鏈是反向平行的,為了明確地表示DNA的方向,通常將DNA的羥基末端稱為3′端,而磷酸基團的末端稱為5′端。DNA聚合酶不能從頭開始合成DNA,而只能從3′端延伸DNA鏈,因此,DNA復制需要引物。當引物與DNA母鏈通過堿基互補配對結(jié)合后,DNA聚合酶就能從引物的3′端開始延伸DNA鏈,DNA的合成方向總是從子鏈的5′端向3′端延伸。
DNA復制方向的示意圖
2.細胞內(nèi)參與DNA復制的各種組成成分和作用是怎樣的?
參與的組分
在DNA復制中的作用
解旋酶
打開DNA雙鏈
DNA母鏈
提供DNA復制的模
2、板
4種脫氧核苷酸
合成子鏈的原料
DNA聚合酶
催化合成DNA子鏈
引物
使DNA聚合酶能夠從引物的3′端開始連接脫氧核苷酸
3.細胞內(nèi)的DNA復制與體外DNA擴增(PCR技術)相同嗎?兩者又有什么關聯(lián)呢?
細胞內(nèi)的DNA復制與體外DNA擴增(PCR技術)是不同的,兩者具體比較見下表:
細胞內(nèi)DNA復制
PCR
不
同
點
解旋
有解旋酶的參與,邊解旋邊復制
80~100 ℃高度解旋,雙鏈完全分開
酶
DNA解旋酶、DNA聚合酶、DNA連接酶
TaqDNA聚合酶
引物
RNA
DNA或RNA
能量
ATP
不加
溫度
體內(nèi)溫和條件
3、
高溫
相同點
① 提供DNA復制的模板;
②四種脫氧核苷酸作原料;
③子鏈延伸的方向都是從5′端到3′端
PCR反應是通過控制溫度使DNA復制在體外反復進行。PCR反應的實質(zhì)就是DNA復制,所以有關PCR反應的題目與DNA復制的原理相同,計算方法也大體相同。例如:PCR反應中的目的片段一般以2n的方式積累,其中n為反應循環(huán)次數(shù)。一個DNA片段在30次循環(huán)后反應物中大約有10億(230)個這樣的片段。
4.當PCR反應體系的溫度經(jīng)快速冷卻到50℃左右時,為什么一般不考慮解開的2個DNA模板鏈又重新結(jié)合了,這是為什么?
原因是:(1)模板DNA比引物長得多、復雜得多、不易重新
4、結(jié)合;
(2)引物和模板之間的碰撞機會遠遠高于模板互補鏈之間的碰撞;
(3)加入的引物的量足夠大而模板鏈數(shù)量少,模板鏈濃度低,不易結(jié)合。
5.為什么PCR能有廣泛用途?除用于DNA擴增外,還有哪些用途?
在生物基因組中存在著許多差異,如物種之間的差異、基因表達上的時間差異、基因表達的地域或組織差異、變異后的差異、生理和病理變化引起的差異、遺傳的差異、雜交的差異等。但這些差異只有在DNA擴增后才能被觀察出來。因此,PCR是這種差異的一種觀察方法,因而在法醫(yī)學上、在遺傳病和其他疾病的診斷、考古中人種的確定、食品質(zhì)量的確定上和基因轉(zhuǎn)移上都可使用?! ?
6.PCR的反應過程具體是怎樣的?
5、
PCR一般要經(jīng)歷三十多次循環(huán),每次循環(huán)可以分為變性(當溫度上升到90 ℃以上時,雙鏈DNA解聚為單鏈)、復性(溫度下降到50 ℃左右,兩種引物通過堿基互補配對與兩條單鏈DNA結(jié)合)和延伸(溫度上升到72 ℃左右,溶液中的四種脫氧核苷酸在DNA聚合酶的作用下,根據(jù)堿基互補配對原則合成新的DNA鏈)三步。從第二輪循環(huán)開始,上一次循環(huán)的產(chǎn)物也作為模板參與反應,并且由引物Ⅰ延伸而成的DNA單鏈會與引物Ⅱ結(jié)合,進行DNA的延伸,這樣,DNA聚合酶只能特異的復制處于兩個引物之間的DNA序列,使這段固定長度的序列成指數(shù)擴增。
第一輪的產(chǎn)物作為第二輪的模板,經(jīng)過變性、復性、延伸三步
↓
第二
6、輪的產(chǎn)物作為第三輪的模板,經(jīng)過變性、復性、延伸三步
↓
題例領悟TILILINGWU
【例題1】 一個由15N標記的DNA分子,放在沒有標記的環(huán)境中培養(yǎng),利用PCR循環(huán)5次后標記的DNA分子占總數(shù)的( )
A.1/10 B.1/5
C.1/16 D.1/25
解析:一個DNA分子利用PCR技術循環(huán)5次后產(chǎn)生的DNA分子數(shù)目為2n。而DNA的復制是半保留復制,其特點是新形成的DNA雙鏈,一條是來自親代DNA分子的母鏈,另一條是新形成的子鏈。這樣最初由15N標記的DNA分子復制后,其標記的兩條鏈就分別進入兩個子代DNA分子中,這樣兩個子代DNA分子被標記了。以后均是
7、在沒有標記的環(huán)境中培養(yǎng),不論經(jīng)過多少次復制,最初標記的兩條鏈始終存在于兩個DNA分子中,這樣經(jīng)過n次循環(huán)后,標記的DNA分子中的2/2n,即1/2n-1。
答案:C
PCR技術的實質(zhì)就是DNA分子的復制。
【例題2】 DNA的復制需要引物,其主要原因是…( )
A.可加快DNA的復制速度
B.引物可與DNA母鏈通過堿基互補配對結(jié)合
C.引物的5′端有助于DNA聚合酶的延伸DNA鏈
D.DNA聚合酶只能從3′端延伸DNA鏈
解析:DNA的兩條鏈是反向平行的,為了明確地表示DNA的方向,通常將DNA的羥基(—OH)末端稱為3′端,而磷酸基團的末端稱為5′端。DNA聚合酶不
8、能從5′端開始合成DNA,而只能從3′端延伸DNA鏈。因此,DNA復制需要引物。當引物與DNA母鏈通過堿基互補配對結(jié)合后,DNA聚合酶就能從引物的3′端開始延伸DNA鏈,DNA的合成方向總是從子鏈的5′端向3′端延伸。
答案:D
DNA復制是有方向的,只能由3′端延伸至5′端,而不能倒過來。
隨堂訓練SUITANGXUNLIAN
11個PCR循環(huán)后,一個由15N標記的DNA分子,放在沒有標記的環(huán)境中培養(yǎng),可產(chǎn)生幾個含15N標記的DNA分子( )
A.1個 B.23=8個
C.2個 D.4個
答案:C 解析:PCR的1次循環(huán),相當于1個DNA分子復制了1次。因為DNA的復制為半保留復制,所以形成了2個帶標記的DNA分子。
2DNA復制需要引物,在引物的輔助下,DNA的復制(延伸)方向是怎樣的( )
A.由3′端延伸至5′端
B.由5′端延伸至3′端
C.由3′端和5′端都可以延伸
D.由DNA分子的中間氫鍵處開始延伸
答案:B 解析:由于DNA聚合酶只能由引物的3′端延伸DNA鏈,而DNA的兩條鏈是反向平行的,所以引物的3′端對應DNA子鏈的5′端,所以從子鏈的5′端向3′端延伸。
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